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长江、珠江、黑龙江水系野生鲢遗传多样性的微卫星分析
引用本文:姬长虹,谷晶晶,毛瑞鑫,朱新平,孙效文.长江、珠江、黑龙江水系野生鲢遗传多样性的微卫星分析[J].水产学报,2009,33(3):364-371.
作者姓名:姬长虹  谷晶晶  毛瑞鑫  朱新平  孙效文
作者单位:1. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;大连水产学院生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023
2. 大连水产学院生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023
3. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
4. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东,广州,510380
5. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070
基金项目:鲤科主养鱼类DNA分子标记的种质鉴定技术(2005DIB4J024)
摘    要:采用34个微卫星分子标记,对长江(湘江、监利、枞阳)、珠江、黑龙江(抚远)鲢共5个群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He )、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡,以近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化。同时,基于Nei氏标准遗传距离获得NJ聚类图。共检测出154个等位基因,其中有80个共有基因。位点等位基因1~9个不等,平均等位基因4.666 7,平均有效等位基因2.948 9。5群体平均观测杂合度为0.329 5~0.461 9,平均期望杂合度为0.500 2~0.552 9,平均多态信息含量为0.443 5~0.493 0。表明5群体为中度多态,遗传多样性较低,且长江不同地理群体的遗传多样性也有差异,但差异不显著。通过群体间遗传相似性和遗传距离比较显示:长江3个群体间遗传相似系数最大,遗传距离最小;黑龙江与长江鲢群体间相似系数较大(平均0.871 8),遗传距离较小(平均0.137 4)表明二者遗传分化亦最小;珠江鲢与长江鲢间的相似系数最小(平均0.831 0),遗传距离最大(平均0.185 2),其遗传分化差异较大,结果未显现出群体间遗传差异的大小与其地理距离远近呈正相关。

关 键 词:  微卫星  遗传多样性
收稿时间:2008/6/28 0:00:00
修稿时间:2008/12/25 0:00:00

Analysis of genetic diversity among wild silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) populations in the Yangtze, Heilongjiang and Pearl Rivers using microsatellite markers
JI Chang-hong,GU Jing-jing,MAO Rui-xin,ZHU Xin-ping,SUN Xiao-wen.Analysis of genetic diversity among wild silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) populations in the Yangtze, Heilongjiang and Pearl Rivers using microsatellite markers[J].Journal of Fisheries of China,2009,33(3):364-371.
Authors:JI Chang-hong  GU Jing-jing  MAO Rui-xin  ZHU Xin-ping  SUN Xiao-wen
Affiliation:Dalian Fishery University,,,,
Abstract:In this paper,genetic diversity of five wild silver carp(Hypophthalmichthys molitrix)populations,collected from the Yangtze River,Pearl River and Heilongjiang River was analyzed using 34 microsatellite markers.The observed(Ho) and expected heterozygosity(He),polymorphism information content(PIC) and number of effective alleles(Ae) were all determined.The genetic similarity coefficient and Nei'S standard genetic distance were computed based on the allele frequencies.The Hardy-Weinberg equilibrium was checked...
Keywords:Hypophthalmichthys molitrix  microsatellite  genetic diversity  
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